В настоящее время пражский метрополитен состоит из трёх линий: 1. Линия «A», которая на схемах обозначается зеленым цветом. 2. Линия «B» , которая обозначается схематически жёлтым цветом. 3. Линия «C», которая обозначается на картах красным цветом. Все три линии пересекаются в центре и образовывают классический треугольник, так же как в Киеве, Харькове и Санкт-Петербурге до открытия четвертой линии. Как ни странно, но буквы обозначения линий не соответствуют порядку их открытия. На самом деле первым был открыт участок красной линии «C», которая проходила между станциями «Kačerov» и «Sokolovská» (теперешнее название «Florenc»). Общая длина веток составляет 59,3 км и включает 57 станции.

В Праге существует три депо: «Kačerov» (красная линия «С»), «Hostivař» (зеленая линия «А») и «Zličín»(желтая линия «В»), при этом каждое из них имеет собственную ветку соединения («гейт») с железной дорогой. Депо желтой ветки «B» изначально планировалось построить не в Зличине, а в Йинонице в 1986−1989 годах.

В день метрополитеном в среднем пользуются от 1,5 до 2 миллионов пассажиров. Работа метрополитена управляется компанией общественного транспорта в Праге (по-чешски Dopravní podnik hl. m. Prahy). В Праге существует единая система проезда в метро для всех видов транспорта, то есть купленные билеты действительны для всех видов транспорта (трамваев, автобусов, фуникулеров, который идет до Петржине). Поэтому нет необходимости в черте города покупать отдельный билет на каждый отдельный вид транспорта. Кроме того такие билеты действительны также в поездах, так называемых, линий S (пригородное железнодорожное сообщение) в черте города.

В последнее время лифты все больше оборудуются лифтами, который обеспечивают доступ в метрополитен для людей с ограниченными физическими способностями.